顯微操作儀在反向充填液體時，適當地在顯微鏡下調查打針針尖，以決定在加壓時是否打針針堵塞或偏斜。堵塞一般可通過將針尖悄悄敲擊一個固定物而得以緩解。針尖偏斜的打針針是適合于顯微打針的，但其運用應做纖細調整或補償打針中加壓所形成的額定偏斜。打針速度過快能打亂細胞質成分，細胞裂解或細胞從底層移位。當打針體積小于估量的細胞體積的10%，而且打針樣品的活動速度幾乎不導致可見的細胞質移位時，打針效果。用紫外光可看到注入符號物后的活細胞，但會對細胞形成不行康復的損害，因而應盡可能縮短紫外光照耀時刻。如果對已經打針的細胞進行免疫熒光測定或其他處理，運用可固定的葡聚糖，以防在沖刷中形成符號物的分散丟失。